En la actualidad, este refugio es administrado por el Ministerio de Ciencia, Tecnología y Medio Ambiente (CITMA), que promueve una variedad de proyectos destinados a la protección de la flora y fauna locales.
El área protegida cuenta con iniciativas respaldadas por el Fondo Mundial para el Medio Ambiente, lo que refuerza su compromiso con la conservación. Entre estos proyectos destaca Ecovalor, que se centra en la generación de beneficios ambientales globales mediante la valoración económica integrada de los bienes y servicios ecosistémicos.
Las Picúas-Cayo Cristo no solo es un refugio esencial para la biodiversidad, sino que también se erige como un modelo de gestión ambiental sostenible en el país.